Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEUROD1Q13562 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEUROD1Q13562 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEUROD1Q13562 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
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