Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAMK2DQ13557 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms