Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B2Q13435 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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