Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTA1Q13424 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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