Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRSQ13332 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRSQ13332 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms