Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
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