Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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