Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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