Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 STE14YDR410C 720 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 RPL40AYIL148W 387 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 snR48snR48 113 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 MES1YGR264C 2256 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 DPB11YJL090C 2295 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 FUS1YCL027W 1539 nt3.6□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 DNM1YLL001W 2274 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 MDM32YOR147W 1869 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 ARF1YDL192W 546 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 RPL22AYLR061W 366 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 ECM16YMR128W 3804 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 RFC3YNL290W 1023 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 YOR050CYOR050C 348 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 YBR064WYBR064W 429 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 RAD61YDR014W 1944 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 ALY1YKR021W 2748 nt3.59□□□□□ -1.83
LPX1Q12405 VIP1YLR410W 3441 nt3.58□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 HTL1YCR020W-B 237 nt3.58□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 PAU13YHL046C 363 nt3.58□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 RSF2YJR127C 4143 nt3.58□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 ELM1YKL048C 1923 nt3.57□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YBR178WYBR178W 375 nt3.57□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 RAD2YGR258C 3096 nt3.57□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 MLH2YLR035C 2088 nt3.56□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 snR55snR55 98 nt3.56□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 DAD4YDR320C-A 219 nt3.56□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YBR137WYBR137W 540 nt3.56□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 NUP133YKR082W 3474 nt3.56□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 SGO1YOR073W 1773 nt3.56□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 RNR1YER070W 2667 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 PAU23YLR037C 375 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 GPI1YGR216C 1830 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 VPS41YDR080W 2979 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 ALG8YOR067C 1734 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YHR078WYHR078W 1659 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 NUP85YJR042W 2235 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 COX1Q0045 1605 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 SCW11YGL028C 1629 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 NUP60YAR002W 1620 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 NAN1YPL126W 2691 nt3.55□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 MVP1YMR004W 1536 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 BUD5YCR038C 1929 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 VPS52YDR484W 1926 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 CBP2YHL038C 1893 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YPR003CYPR003C 2265 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YDR048CYDR048C 315 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 RPS22BYLR367W 393 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 DBP6YNR038W 1890 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 REV1YOR346W 2958 nt3.54□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 RSC1YGR056W 2787 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 ZDS1YMR273C 2748 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 MZM1YDR493W 372 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 YJL150WYJL150W 303 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 LCL2YLR104W 396 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 SHQ1YIL104C 1524 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 NPR2YEL062W 1848 nt3.53□□□□□ -1.84
LPX1Q12405 CSN9YDR179C 489 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 PAU10YDR542W 363 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YER088C-AYER088C-A 324 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 PAU11YGL261C 363 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 COA4YLR218C 453 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 PAU4YLR461W 363 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 MPS1YDL028C 2295 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 AKR1YDR264C 2295 nt3.52□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 FRE8YLR047C 2061 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YKU70YMR284W 1809 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 JJJ2YJL162C 1752 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 SWI1YPL016W 3945 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YDL011CYDL011C 324 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 FRQ1YDR373W 573 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YGL052WYGL052W 306 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YGL074CYGL074C 327 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YJL135WYJL135W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 HSK3YKL138C-A 210 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 STN1YDR082W 1485 nt3.51□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 APE2YKL157W 2859 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 CCT7YJL111W 1653 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 TRS120YDR407C 3870 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 XRS2YDR369C 2565 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 RPL14BYHL001W 417 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 HTB2YBL002W 396 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 PRP39YML046W 1890 nt3.5□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 KIP3YGL216W 2418 nt3.49□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 SLP1YOR154W 1764 nt3.49□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 BCK2YER167W 2556 nt3.49□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 LCB5YLR260W 2064 nt3.49□□□□□ -1.85
LPX1Q12405 GPG1YGL121C 381 nt3.49□□□□□ -1.85
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