Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 SRL4YPL033C 846 nt1.08□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 PES4YFR023W 1836 nt1.08□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 HOP2YGL033W 657 nt1.07□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 STF2YGR008C 255 nt1.07□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YOR114WYOR114W 885 nt1.07□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 BST1YFL025C 3090 nt1.07□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YIL166CYIL166C 1629 nt1.07□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 IRE1YHR079C 3348 nt1.07□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 CTF13YMR094W 1437 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 SKI3YPR189W 4299 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 TTI1YKL033W 3117 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 PET100YDR079W 336 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 CTK2YJL006C 972 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YJR023CYJR023C 402 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 GPN3YLR243W 819 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 HUG1YML058W-A 207 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YBL094CYBL094C 333 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 MNL2YLR057W 2550 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 RPH1YER169W 2391 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 PTC5YOR090C 1719 nt1.06□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 SRD1YCR018C 666 nt1.05□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YGL118CYGL118C 438 nt1.05□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 RPS25AYGR027C 327 nt1.05□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YHR212CYHR212C 336 nt1.05□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YAR060CYAR060C 336 nt1.05□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 RXT2YBR095C 1293 nt1.05□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 SMC4YLR086W 4257 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 MDS3YGL197W 4464 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YIL089WYIL089W 618 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 AIM41YOR215C 558 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 NOP12YOL041C 1380 nt1.04□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 MLH3YPL164C 2148 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 IML1YJR138W 4755 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 AIM6YDL237W 1173 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 SNO3YFL060C 669 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YNL114CYNL114C 372 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 SNO2YNL334C 669 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 PIP2YOR363C 2991 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 SCC2YDR180W 4482 nt1.03□□□□□ -2.24
RTR2Q12378 DOP1YDR141C 5097 nt1.02□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 snR68snR68 136 nt1.02□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YJL015CYJL015C 285 nt1.02□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SNC1YAL030W 354 nt1.02□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 RRT15YLR162W-A 189 nt1.02□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SEC63YOR254C 1992 nt1.02□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 CTR9YOL145C 3234 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 FRK1YPL141C 2598 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YDR124WYDR124W 975 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 AI5_BETAQ0075 1065 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MFA1YDR461W 111 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YAR068WYAR068W 486 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 CDC24YAL041W 2565 nt1.01□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 CDC53YDL132W 2448 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 APL2YKL135C 2181 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 PLP1YDR183W 693 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 ATX2YOR079C 942 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 EGD1YPL037C 474 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 NAN1YPL126W 2691 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 HMI1YOL095C 2121 nt1□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MSN5YDR335W 3675 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SHE9YDR393W 1371 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MAK10YEL053C 2202 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YDL062WYDL062W 426 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YFR054CYFR054C 579 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 CIC1YHR052W 1131 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MER1YNL210W 813 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 ROM2YLR371W 4071 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 ASI3YNL008C 2031 nt0.99□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SIP4YJL089W 2490 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 TRM732YMR259C 4263 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MSS11YMR164C 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YOL162WYOL162W 648 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YOR152CYOR152C 771 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MRPL40YPL173W 894 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 ASM4YDL088C 1587 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 HIR3YJR140C 4947 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 BFR1YOR198C 1413 nt0.98□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SPO75YLL005C 2607 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SRB4YER022W 2064 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 MCM22YJR135C 720 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 CTK3YML112W 891 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 YMR099CYMR099C 894 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 GRE2YOL151W 1029 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 ASG1YIL130W 2895 nt0.97□□□□□ -2.25
RTR2Q12378 SHE4YOR035C 2370 nt0.96□□□□□ -2.26
RTR2Q12378 RMD5YDR255C 1266 nt0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 136.5 ms