Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPOCK1Q08629 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms