Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR1Q08345 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR1Q08345 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms