Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms