Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms