Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms