Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FMODQ06828 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms