Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNEQ04844 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms