Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms