Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms