Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F1Q03052 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms