Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms