Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEFA6Q01524 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms