Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms