Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSF1Q00613 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms