Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms