Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2BQ00403 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms