Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2C1P98194 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms