Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms