Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP5P82980 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP5P82980 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP5P82980 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP5P82980 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP5P82980 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP5P82980 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP5P82980 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms