Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms