Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCS1P62166 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms