Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms