Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms