Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms