Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FXYD4P59646 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms