Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms