Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms