Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms