Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC5A3P53794 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC5A3P53794 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC5A3P53794 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms