Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOSBP53539 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOSBP53539 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms