Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LUMP51884 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LUMP51884 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LUMP51884 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LUMP51884 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms