Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN6P51797 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN6P51797 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms