Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCN3P51790 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCN3P51790 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms