Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms