Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms