Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMTP48728 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMTP48728 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMTP48728 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMTP48728 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms