Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms