Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCAMP43121 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCAMP43121 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCAMP43121 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCAMP43121 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCAMP43121 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCAMP43121 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCAMP43121 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCAMP43121 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCAMP43121 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCAMP43121 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCAMP43121 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCAMP43121 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms