Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC5P40937 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC5P40937 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC5P40937 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC5P40937 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC5P40937 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms