Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL1P40616 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms